STATISTICAL ANALYSIS OF NEXT GENERATION SEQUENCING DATA FRONTIERS IN PROBABILITY AND THE STATISTICAL SCIENCES

Download Statistical Analysis Of Next Generation Sequencing Data Frontiers In Probability And The Statistical Sciences ebook PDF or Read Online books in PDF, EPUB, and Mobi Format. Click Download or Read Online button to STATISTICAL ANALYSIS OF NEXT GENERATION SEQUENCING DATA FRONTIERS IN PROBABILITY AND THE STATISTICAL SCIENCES book pdf for free now.

Statistical Analysis Of Next Generation Sequencing Data

Author : Somnath Datta
ISBN : 9783319072128
Genre : Medical
File Size : 70.4 MB
Format : PDF, ePub
Download : 857
Read : 578

Next Generation Sequencing (NGS) is the latest high throughput technology to revolutionize genomic research. NGS generates massive genomic datasets that play a key role in the big data phenomenon that surrounds us today. To extract signals from high-dimensional NGS data and make valid statistical inferences and predictions, novel data analytic and statistical techniques are needed. This book contains 20 chapters written by prominent statisticians working with NGS data. The topics range from basic preprocessing and analysis with NGS data to more complex genomic applications such as copy number variation and isoform expression detection. Research statisticians who want to learn about this growing and exciting area will find this book useful. In addition, many chapters from this book could be included in graduate-level classes in statistical bioinformatics for training future biostatisticians who will be expected to deal with genomic data in basic biomedical research, genomic clinical trials and personalized medicine. About the editors: Somnath Datta is Professor and Vice Chair of Bioinformatics and Biostatistics at the University of Louisville. He is Fellow of the American Statistical Association, Fellow of the Institute of Mathematical Statistics and Elected Member of the International Statistical Institute. He has contributed to numerous research areas in Statistics, Biostatistics and Bioinformatics. Dan Nettleton is Professor and Laurence H. Baker Endowed Chair of Biological Statistics in the Department of Statistics at Iowa State University. He is Fellow of the American Statistical Association and has published research on a variety of topics in statistics, biology and bioinformatics.
Category: Medical

Encyclopedia Of Bioinformatics And Computational Biology

Author :
ISBN : 9780128114322
Genre : Medical
File Size : 53.40 MB
Format : PDF, Docs
Download : 875
Read : 422

Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology: ABC of Bioinformatics combines elements of computer science, information technology, mathematics, statistics and biotechnology, providing the methodology and in silico solutions to mine biological data and processes. The book covers Theory, Topics and Applications, with a special focus on Integrative –omics and Systems Biology. The theoretical, methodological underpinnings of BCB, including phylogeny are covered, as are more current areas of focus, such as translational bioinformatics, cheminformatics, and environmental informatics. Finally, Applications provide guidance for commonly asked questions. This major reference work spans basic and cutting-edge methodologies authored by leaders in the field, providing an invaluable resource for students, scientists, professionals in research institutes, and a broad swath of researchers in biotechnology and the biomedical and pharmaceutical industries. Brings together information from computer science, information technology, mathematics, statistics and biotechnology Written and reviewed by leading experts in the field, providing a unique and authoritative resource Focuses on the main theoretical and methodological concepts before expanding on specific topics and applications Includes interactive images, multimedia tools and crosslinking to further resources and databases
Category: Medical

Immune System Modeling And Analysis

Author : Ramit Mehr
ISBN : 9782889195015
Genre :
File Size : 49.68 MB
Format : PDF
Download : 608
Read : 1246

The rapid development of new methods for immunological data collection – from multicolor flow cytometry, through single-cell imaging, to deep sequencing – presents us now, for the first time, with the ability to analyze and compare large amounts of immunological data in health, aging and disease. The exponential growth of these datasets, however, challenges the theoretical immunology community to develop methods for data organization and analysis. Furthermore, the need to test hypotheses regarding immune function, and generate predictions regarding the outcomes of medical interventions, necessitates the development of mathematical and computational models covering processes on multiple scales, from the genetic and molecular to the cellular and system scales. The last few decades have seen the development of methods for presentation and analysis of clonal repertoires (those of T and B lymphocytes) and phenotypic (surface-marker based) repertoires of all lymphocyte types, and for modeling the intricate network of molecular and cellular interactions within the immune systems. This e-Book, which has first appeared as a ‘Frontiers in Immunology’ research topic, provides a comprehensive, online, open access snapshot of the current state of the art on immune system modeling and analysis.
Category:

Operations Research

Author : Frederick S. Hillier
ISBN : 9783486792089
Genre : Business & Economics
File Size : 47.94 MB
Format : PDF, Mobi
Download : 183
Read : 1149

Aus dem Inhalt: Was ist Operations Research? Überblick über die Modellierungsgrundsätze des Operations Research. Einführung in die lineare Programmierung. Die Lösung linearer Programmierungsprobleme: Das Simplexverfahren. Stochastische Prozesse. Warteschlangentheorie. Lagerhaltungstheorie. Prognoseverfahren. Markov-Entscheidungsprozesse. Reliabilität. Entscheidungstheorie. Die Theorie des Simplexverfahrens Qualitätstheorie und Sensitivitätsanalyse Spezialfälle linearer Programmierungsprobleme. Die Formulierung linearer Programmierungsmodelle und Goal-Programmierung. Weitere Algorithmen der linearen Programmierung. Netzwerkanalyse einschließlich PERT-CPM. Dynamische Optimierung. Spieltheorie. Ganzzahlige Programmierung. Nichtlineare Programmierung Simulation. Anhang. Lösungen für ausgewählte Übungsaufgaben.
Category: Business & Economics

Kologie

Author : Michael Begon
ISBN : 9783662499061
Genre : Science
File Size : 27.10 MB
Format : PDF, Docs
Download : 943
Read : 1143

Dieses Ökologie-Lehrbuch führt in leicht verständlicher Weise in die Grundlagen – von den theoretischen Fundamenten bis zu Ihren praktischen Anwendungen - ein. Durchgehend farbige Abbildungen, einfache didaktische Elemente und eine Fülle an Beispielen machen dieses Buch zu einem idealen Einstieg in die Ökologie für Studierende aller Studienabschnitte. Neu in der 3. Auflage sind zusätzliche Erläuterungen in Form von Sprechblasen in den Abbildungen und die neue Gliederung des Textes in 5 Abschnitte. Ökosystem und Biogeochemie werden ausführlicher behandelt und hunderte neuer Studien sowohl für die grundlegenden als auch für die angewandten Aspekte der Ökologie werden einbezogen.
Category: Science

Die Sieben T Chter Evas

Author : Bryan Sykes
ISBN : 3404605152
Genre : Science
File Size : 88.30 MB
Format : PDF, ePub, Docs
Download : 610
Read : 542

650 Millionen Europäer sollen von nur sieben Urmüttern abstammen? Sie meinen, das kann nicht sein? Bryan Sykes, Professor für Genetik an der Universität Oxford, hat die Mitochondrien-DNA Tausender Europäer analysiert und konnte dabei sieben Bausteine entdeckten, die sich auf sieben Töchter der Urmutter Eva zurückführen lassen. Darüber hinaus lässt sich sagen, wann unsere Vorfahren erstmals auftraten, wo und wie sie lebten und wohin sie gingen ═ somit kann jeder von uns herausfinden, von welchem der sieben Stämme er abstammt: Folgen Sie Bryan Sykes auf seiner sensationellen Reise in unsere Vergangenheit!
Category: Science

The Least Cost Path From Landscape Genetics To Landscape Genomics

Author : Samuel A. Cushman
ISBN : 9782889455485
Genre :
File Size : 41.97 MB
Format : PDF, Mobi
Download : 126
Read : 735

Ecosystems are the stage on which the play of evolution is acted, and ecosystems are complex, spatially structured and temporally varying. The purpose of this Research Topic is to explore critical challenges and opportunities for the transition from landscape genetics to landscape genomics. Landscape genetics has focused on the spatial analysis of small genetic datasets, typically comprised of less than 20 microsatellite markers, taken from clusters of individuals in putative populations or distributed individuals across landscapes. The recent emergence of large scale genomic datasets produced by next generation sequencing methods poses tremendous challenge and opportunity to the field. Perhaps the greatest is to produce, process, curate, archive and analyze spatially referenced genomic datasets in a way such that research is led by a priori hypotheses regarding how environmental heterogeneity and temporal dynamics interact to affect gene flow and selection. The papers in the Research Topic cover a broad range of topics under this area of focus, from reviews of the emergence of landscape genetics, to best practices in spatial analysis of genetic data. The compilation, like the emerging field itself, is eclectic and illustrates the scope of both the challenges and opportunities of this emerging field.
Category:

Entschl Sselt

Author : J. Craig Venter
ISBN : 3100870301
Genre :
File Size : 29.3 MB
Format : PDF, Mobi
Download : 306
Read : 921

Category:

Mathematisches Denken

Author : T.W. Körner
ISBN : 9783034850018
Genre : Science
File Size : 77.36 MB
Format : PDF, Kindle
Download : 122
Read : 464

Dieses Buch wendet sich zuallererst an intelligente Schüler ab 14 Jahren sowie an Studienanfänger, die sich für Mathematik interessieren und etwas mehr als die Anfangsgründe dieser Wissenschaft kennenlernen möchten. Es gibt inzwischen mehrere Bücher, die eine ähnliche Zielstellung verfolgen. Besonders gern erinnere ich mich an das Werk Vom Einmaleins zum Integral von Colerus, das ich in meiner Kindheit las. Es beginnt mit der folgenden entschiedenen Feststellung: Die Mathematik ist eine Mausefalle. Wer einmal in dieser Falle gefangen sitzt, findet selten den Ausgang, der zurück in seinen vormathematischen Seelenzustand leitet. ([49], S. 7) Einige dieser Bücher sind im Anhang zusammengestellt und kommen tiert. Tatsächlich ist das Unternehmen aber so lohnenswert und die Anzahl der schon vorhandenen Bücher doch so begrenzt, daß ich mich nicht scheue, ihnen ein weiteres hinzuzufügen. An zahlreichen amerikanischen Universitäten gibt es Vorlesungen, die gemeinhin oder auch offiziell als ,,Mathematik für Schöngeister'' firmieren. Dieser Kategorie ist das vorliegende Buch nicht zuzuordnen. Statt dessen soll es sich um eine ,,Mathematik für Mathematiker'' handeln, für Mathema tiker freilich, die noch sehr wenig von der Mathematik verstehen. Weshalb aber sollte nicht der eine oder andere von ihnen eines Tages den Autor dieses 1 Buches durch seine Vorlesungen in Staunen versetzen? Ich hoffe, daß auch meine Mathematikerkollegen Freude an dem Werk haben werden, und ich würde mir wünschen, daß auch andere Leser, bei denen die Wertschätzung für die Mathematik stärker als die Furcht vor ihr ist, Gefallen an ihm finden mögen.
Category: Science